Наукові публікації університету

Can we treat ab initio atomic charges and bond orders as conformation-independent electronic structure descriptors?

Chemically meaningful descriptors of molecular electronic structure which can be calculated from the results of ab initio calculations in a well-defined manner play an important role in establishing a fundamental link between chemistry and physics. Bond orders (BOs) and effective atomic charges, both expressible in terms of the electron density matrix and the overlap matrix, comprise examples of such descriptors. In the present paper the dependence of BOs (calculated by NPA-Wiberg, Natiello–Medrano and Mayer methods) and atomic charges (calculated by Natural Population Analysis (NPA) and Löwdin schemes) on the conformation of DNA deoxyribonucleoside 2′-deoxycytidine is investigated. Strong correlations between the studied descriptors of molecular structure calculated by different methods are revealed and discussed. The atoms and bonds of 2′-deoxycytidine exhibiting the most pronounced dependence of their effective charges and bond orders on the conformation are identified.

ID: 167843
Кількість показів: 71
дата змінення: 11.11.2016 09:09:01
Ким змінено (ім'я): (ivt3) Іван Войтешенко
Вид роботи:  Наукова публікація
Тип роботи:  Наукова стаття
Кількість сторінок:  12
Рік видання:  2016
Звітний рік:  2016
Видання:  RSC Advances
Том:  6
Випуск, частина:  78
Номери сторінок:  74785-74796
Галузь науки:  Міждисциплінарні науки
Автори,співробітники Університету:  Ніколаєнко Тимофій Юрійович / Булавін Леонід Анатолійович / Говорун Дмитро Миколайович
Кількість недоданих авторів:  0
Кафедра / Відділ:  Кафедра молекулярної біології, біотехнології та біоінформатики / НДЛ Хіміко-біологічні методи дослідження матеріалів / Молекулярної фізики / НДЛ Фізика рідин, полімерів та фазових переходів в них
№ теми:   / 
Посилання на статтю (посилання на рецензію в журналі (для монографій):  http://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2016/ra/c6ra17055b#!divAbstract
Ключові слова:  Natural Population Analysis (NPA)
Опубліковано за рішенням Вченої ради:  ні
Інститут/Факультет:  Фізичний факультет / Інститут високих технологій

Повернення до списку

Вгору