Наукові публікації університету

Quantum-chemical analysis of geometric and energetic characteristics of hetero associates M9*ade•M1*ura in main tautomeric form

For the first time, on the quantum-mechanical level of theory MP2/6-311++G(2df,pd)//B3LYP/6-311++G(d,p), a full set of hydrogen (H)-bonded hetero associates m9Ade·m1Ura in the main tautomeric forms consisting of 18 different structures was obtained. Their
structural and energetical parameters were characterized and basic physical and chemi-cal characteristics of intermolecular H-bonds that stabilize the investigated complexes were described. It was shown that global minimum of Gibbs free energy corresponds to Hoogsteen pair, after it with a small margin follow Watson–Crick pair, inverse Hoogsteen pair and inverse Watson–Crick pair. It was found that in stabilization of identified hetero associates four types of H-bonds – NH...O, NH...N, CH...O and CH...N are in-
volved. In this case non-canonical CH...O and CH...N bonds show a linear dependence of energy on electron density in the corresponding critical point. Obtained data may be useful for experimental interpretation of the features of non-canonical base pairs asso-
ciation by common methods of spectroscopy, including NMR and vibrational spectroscopy. They are also important for understanding the problem of mutational variability that is caused by formation of non-complementary pairs of nucleotide bases whose role is not clear yet.

ID: 167932
Кількість показів: 99
дата змінення: 14.11.2016 13:31:23
Ким змінено (ім'я): (ivt3) Іван Войтешенко
Вид роботи:  Наукова публікація
Тип роботи:  Наукова стаття
Кількість сторінок:  8
Рік видання:  2015
Звітний рік:  2016
Видання:  Біологічні студії. Studia Bilogica
Том:  9
Випуск, частина:  3
Номери сторінок:  15–22
Галузь науки:  Міждисциплінарні науки
Автори,співробітники Університету:   / Войтешенко Іван Сергійович / Говорун Дмитро Миколайович
Кількість недоданих авторів:  0
Кафедра / Відділ:  Кафедра молекулярної біології, біотехнології та біоінформатики / НДЛ Хіміко-біологічні методи дослідження матеріалів
№ теми: 
Ключові слова:  quantum chemistry, hetero associates of nucleotide bases, hydrogen bonds, adenine, uracil
Опубліковано за рішенням Вченої ради:  ні
Інститут/Факультет:  Інститут високих технологій

Повернення до списку

Вгору