Наукові публікації університету

Computer Simulation of Molecular Interaction Between Baclofen and the GABAB Receptor

In our previous work [1], we have reconstructed the spatial structure of a full-size GABAB receptor using computer simulation. Considering the fact that baclofen is a selective agonist of this receptor, we attempted to search for binding sites of the molecule of this agent with the extracellular domain of a GABAB1 receptor subunit, assessed the molecular dynamics of their interaction, and calculated the energy of nonvalent interactions between the receptor and agonist molecule under study. A molecular docking approach used to estimate interactions between baclofen and the GABAB receptor extracellular domain allowed us to choose three sites for possible binding of the baclofen molecule to the receptor. Using molecular dynamics simulation, we identified two sites capable of providing stable coupling of baclofen with the GABAB receptor.

ID: 196986
Кількість показів: 39
дата змінення: 01.11.2017 22:22:45
Ким змінено (ім'я): (ivt5) Олександр Дудченко
Вид роботи:  Наукова публікація
Тип роботи:  Наукова стаття
Кількість сторінок:  6
Рік видання:  2017
Звітний рік:  2017
Видання:  Neurophysiology
Том:  49
Випуск, частина:  1
Номери сторінок:  2-7
Галузь науки:  Молекулярна біологія
Автори,співробітники Університету:  Нипорко Олексій Юрійович / Войтешенко Іван Сергійович / Цимбалюк Ольга Володимирівна / Давидовська Тамара Леонідівна
Автори зовнішні:  Сагач Вадим Федорович / Шаповал Людмила Миколаївна
Автори,студенти та аспіранти Університету:  Науменко Анна Миколаївна
Кафедра / Відділ:  Кафедра молекулярної біології, біотехнології та біоінформатики
№ теми: 
Посилання на статтю (посилання на рецензію в журналі (для монографій):  https://link.springer.com/article/10.1007/s11062-017-9623-0
Ключові слова:  baclofen, GABAb receptor, computer simulation, molecular docking, molecular dynamics
Опубліковано за рішенням Вченої ради:  ні
Інститут/Факультет:  Інститут високих технологій

Повернення до списку

Вгору