Наукові публікації університету

Straightforward hit identification approach in fragment-based discovery of bromodomain-containing protein 4 (BRD4) inhibitors

A combination approach of a fragment screening and “SAR by catalog” was used for the discovery of bromodomain-containing protein 4 (BRD4) inhibitors. Initial screening of 3695-fragment library against bromodomain 1 of BRD4 using thermal shift assay (TSA), followed by initial hit validation, resulted in 73 fragment hits, which were used to construct a follow-up library sel ected from available screening collection. Additionally, analogs of inactive fragments, as well as a set of randomly selected compounds were also prepared (3 × 3200 compounds in total). Screening of the resulting sets using TSA, followed by re-testing at several concentrations, counter-screen, and TR-FRET assay resulted in 18 confirmed hits. Compounds derived fr om the initial fragment set showed better hit rate as compared to the other two sets. Finally, building dose-response curves revealed three compounds with IC50 = 1.9–7.4 μM. For these compounds, binding sites and conformations in the BRD4 (4UYD) have been determined by docking.

ID: 220221
Кількість показів: 39
дата змінення: 14.11.2018 14:42:13
Ким змінено (ім'я): (chem7) Тетяна Любчук
Вид роботи:  Наукова публікація
Тип роботи:  Наукова стаття
Кількість сторінок:  7
Рік видання:  2018
Звітний рік:  2018
Видання:  Bioorganic and Medicinal Chemistry
Том:  26
Випуск, частина:  12
Номери сторінок:  3399-3405
Галузь науки:  Хімія
Автори,співробітники Університету:  Мороз Юрій Сергійович / Гурмач Василь Васильович / Григоренко Олександр Олегович
Автори зовнішні:  Бориско П. / Васильченко О.В. / Стародубцева А. / Зозуля С.О. / Кондратов Іван Сергіович
Автори,студенти та аспіранти Університету:  Нестерук Катерина Володимирівна
Кількість недоданих авторів:  1
Кафедра / Відділ:  НДЛ Біорегулятори природного та синтетичного походження / Органічної хімії / Хіміко-біологічний центр
№ теми: 
Посилання на статтю (посилання на рецензію в журналі (для монографій):  https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0968089618305285
Ключові слова:  Fragment-based drug discovery; SAR by catalog; Thermal shift assay; Epigenetic targets; Bromodomains
Опубліковано за рішенням Вченої ради:  ні
Інститут/Факультет:  ННЦ "Інститут біології та медицини" / Хімічний факультет

Повернення до списку

Вгору